哥斯拉：最後的戰鬥于2004年上映。

遙遠的幾十年後，過度發達的科技讓地球苦不堪言。由於人類濫用地球資源進行核試驗、生化試驗，導致全球自然生態系統崩潰，一些長眠地下的怪獸紛紛蘇醒，長相畸形、力大無窮的怪獸們是大自然的終極反撲，大肆破壞人類家園。
　　未來世界因為核戰污染，導致人類出現了基因突變的變種人。恐怖怪獸的威脅讓人類放下彼此恩怨，決心攜手保衛家園。於是保衛地球免於怪獸蹂躪的辦法，帥哥遍地的地球防衛軍，與美女如雲的M機關便因此成立，擔負守衛地球與人類文明的重責大任出馬對抗怪獸。
　　一年前與哥吉拉的決戰，機龍受損程度37%，失去了右腕及終極武器絕對零度炮。 維修組員中條義人在八王子基地負責修復機龍的工作。某日中條在他叔叔信一的別墅家渡假時，嬰兒島的小美人精靈竟然出現在他們眼前。小美人給他們一個忠告：人類用哥吉拉骸骨製造出機龍是個嚴重的錯誤，如果出動機龍，哥斯拉就會變成人類的敵人。於是信一設法說服老友也是身為總理大臣的五十嵐，希望能中止機龍的計劃。
　　然後在一個風和日麗的日子，天空出現了巨大的不明飛行物體，原來是「X星人」。他們帶來征服怪物的法寶，卻把人類逐一改造。
　　人類為了擊退怪獸們和外星人，只得請怪獸之王--「哥斯拉」出馬，在世界範圍內拯救地球！

出演哥斯拉：最後的戰鬥的明星有松岡昌宏, 菊川憐。